Идея создания группы, исполняющей мелодичный блэк-метал, приходит в голову клавишнице по прозвищу Hydra Gorgonia, известной по группам In Vitro Veritas и Suspekt. Годом возникновения группы считается 2002-й. Позже к ней присоединяются старые знакомые: барабанщик Fugger (бывший участник Ego) и бас-гитарист Orpheus. Спустя несколько месяцев к троице присоединяется гитарист Scathar (бывший член группы The Chronic). Не хватало только вокалиста. На творчество коллектива оказала влияние музыка Бетховена и Брамса, русских композиторов, Dimmu Borgir, Graveworm, Finntroll, Summoning и Ханса Циммера.В 2003 команда работает над сочинением собственных композиций. В результате в студии Stonehenge в Бонне было записано 7 песен. В записи альбома принял участие гитарист Вольфганг Мейерхофф. В апреле 2004-го группа, наконец, смогла завершить работу над дебютником во многом благодаря вокальному таланту Омера Хамзаоглу. Неожиданностью стал уход бас-гитариста. Но прошло не так много времени, как это место было занято опытным музыкантом под псевдонимом Kalaschnikow. Ещё через два месяца в составе проекта появляется вокалист Chim, сменив недолго находившегося у микрофона Кристиана Шмитца. На Хэллоуин группе удается выступить с первым концертом. В ноябре формация записывает первую профессиональную видеокассету в сотрудничестве с Никласом Хлаватчем и его съемочной группой. В 2005-м выходит концертный DVD-альбом "Live 2005". C начала 2005 года музыканты готовят второй альбом. На Пасху они отправляются в студию Stonehenge, чтобы записать "The Eyes of Medusa". Затем Atrium Noctis дают несколько концертов, разделив сцену с Saqar, Grabnebelfürsten, Escape Mortalitiy, Hate Anthem и Discratio. Из-за большого расстояния между Франкфуртом и Кёльном, которое приходилось преодолевать вокалисту Chim'у, он решает покинуть группу, на его место был принят Benny. И уже в ноябре Atrium Noctis выступают с новым вокалистом. В начале 2006-го в состав возвращается Orpheus, а также был принят второй гитарист Sturm. Как раз вовремя, поскольку впереди намечалось несколько выступлений: Metalnight Neuss, Privlieg в Кёльне и MTC. В октябрьском издании журнала Legacy появляется песня "Zerberon", а также было напечатано интервью с группой. После успешного выступления на Q1 с командами Sacrasphemy и Aardvarks, Benny подумывает расстаться с коллегами по цеху. В 2007 году, к сожалению, Benny окончательно решается уйти из группы. В октябре состоялся его прощальный концерт. Это было на мероприятии Q1, на котором формация выступала вместе с Insignium и Dark Wire. Начинаются поиски нового вокалиста, и в 2008 году за микрофон становится Damian. Он приехал прямо на репетицию в начале февраля, когда шла работа над первой половиной нового альбома. Однако, 2008 год был омрачен тяжелой болезнью гитариста Scathar'а. К концу года музыкант поправился и смог приступить к работе.В феврале 2009-го из-за личных разногласий гитарист Sturm покидает проект. Тем не менее музыканты продолжают сочинять материал, а летом всё в той же студии Stonehenge под руководством Оливера с успехом его записывают. Мастеринг проводился на студии Strype Audio (Норвегия), а Джеральд Аксельрод любезно согласился предоставить музыкантам одну из своих фотографий для обложки. После возвращения из Норвегии Atrium Noctis начинают поиски лейбла. Тем временем состав пополняется сессионным гитаристом по прозвищу Mahr.2010 год был успешным для музыкантов. В июне они подписывают контракт с Naturmacht Produktionen, и ровно через месяц в продажу поступает третий альбом под названием "Home", на котором был представлен клип на песню "Spuren Eines Wolfes". Работа получает отличные отзывы. В этом же году были концерты в Кёльне, Бонне и Бергиш-Гладбахе. Команда выступает с Thrudvangar, Memoriam, Tormentor, Kadavrik, Met, Skadika, Andras и Insignium.Период с 2011 по 2012 годы богат на события. После долгих лет сотрудничества команду покидают Scathar, Orpheus и Damian, а Sturm возвращает обратно, вместе с ним приходит и новый гитарист Thyratus. Набрав гитаристов, Atrium Noctis более не нуждаются в услугах Mahr'а, но поиски вокалиста не прекращались. Все кандидатуры не подходили, были ненадёжными. 22 октября 2011-го группа выступает в Нюрнберге. В следующие месяцы коллектив начинает работу над новыми песнями и концепцией к новому альбому. В 2012 году состав пополнятся бас-гитаристом Erykk'ом, который приступил к своим обязанностям с большим усердием, а в 2013 году обратно возвращается Benny. В этом же году уходит барабанщик Fugger, в качестве сессионного ударника был принят Ник Хомфельд. Работа над новым альбомом ещё продолжается. На 2014 год группа планирует выпустить видеодиск.