Занимаясь изучением различных религий, С. И. Иваненко выпустил ряд книг о православном христианстве, российском индуизме и Свидетелях Иеговы: «Наука и православие» (1984), «Христианские партии и самодеятельные объединения» (1990), «Религиозные самодеятельные объединения в наши дни» (1990), «Новые религиозные объединения: поиски, противоречия, надежды» (1991), «Партии, движения, союзы России с религиозными приоритетами» (1993), «Кришнаиты в России: правда и вымысел» (1998), «О людях, никогда не расстающихся с Библией» (1999), «Вайшнавская традиция в России» (2008) а также свыше 70 научных статей.Активно занимается журналистикой, опубликовал ряд статей о религиозной жизни России в изданиях, выходящих во Франции, Германии и Италии.В 1996 году С. И. Иваненко также выступил руководителем авторского коллектива справочника «Религиозные объединения Российской Федерации».Последняя книга С. И. Иваненко, «Вайшнавская традиция в России», вышла в 2008 году и посвящена индуистской традиции гаудия-вайшнавизма (кришнаизма) в России.