В 9784 году по летоисчислению Содружества, Ницшеанцы подняли восстание против Содружества Систем с целью свергнуть его и установить Ницшеанскую Империю.Крейсер Звёздной Гвардии Содружества «Созвездие Андромеды» под командованием капитана Дилана Ханта попадает в засаду ницшеанского флота. По приказу капитана экипаж «Андромеды» покидает судно на спасательных челноках. А «Андромеда» с Диланом Хантом на борту становится пленником временной аномалии на границе Чёрной дыры в системе Гефест.Через 303 года экипажу корабля «Эврика Мару» под командованием Беки Валентайн удаётся вытащить крейсер Звёздной Гвардии с орбиты Чёрной дыры.«Долгая Ночь» — так были названы прошедшие после Падения Содружества Систем 3 столетия. Империя Ницшеанцев так и не была создана, и Вселенная погрузилась во тьму и хаос.Дилан Хант, для которого прошло всего лишь мгновение, берёт на себя миссию по восстановлению Содружества Систем.