Кларк возвращается , хотя он не совсем является обычным. Кларк был перепрограммирован Джор-Элом , чтобы искать камни власти со всего мира .Лоис-Лейн прибывает в Смолвиль, чтобы искать правду о смерти своей кузины Хлои. Лоис находит утратившего память Кларка, возвращенного в Смолвиль после 3-месячного отсутствия, и доставляет его в больницу. Лана, все еще в Париже и с новым любовным увлечением, исследует древнюю мученицу, Графиню Маргарет Изабель Торо, которая связана с Ланой больше чем, она знает. Джонатан лежит в коме, Марта рядом с ним; Лайнел ожидает своего суда. Кларк выходит на футбольную команду, его отношения с Лексом начинают полностью рушиться, встречает будущих супергероев и старые навязчивые идеи, и борется против ведьм с 17-ого столетия как раз вовремя, чтобы закончить среднюю школу Смолвиля, истинное предназначение Кларка показана ему к концу сезона, второй метеоритный дождь прибывает в Смолвиль.